非模式菌株基因编辑新突破:粪产碱菌內源CRISPR系统实现基因组大片段删除
近日,我司技术团队与高校科研团队合作,在重要环境微生物粪产碱菌基因编辑领域取得进展,成功开发了该菌株內源CRISPR/Cas基因编辑平台。利用该技术实现粪产碱菌达47 kb的基因组大片段删除,为开展该细菌功能基因组学研究和代谢工程改造提供了强有力的工具,为非模式菌株基因敲除提供了新的技术路径。
研究背景:非模式菌株基因编辑的挑战
粪产碱菌是一种重要的工业环境微生物,因其突出的污染物生物降解能力与独特的好氧反硝化特征受到广泛关注。然而,对粪产碱菌的基因编辑一直面临巨大挑战,Cas9等异源核酸酶对其具有显著的细胞毒性;传统的基因编辑方法耗时耗力、效率低下,严重制约了粪产碱菌菌功能基因的研究和应用开发。这类非模式菌株的基因敲除技术需求日益迫切。
技术突破:內源CRISPR系统助力细菌基因敲除
我司技术团队联合高校科研团队,针对粪产碱菌基因编辑的技术瓶颈,开展如下工作:
- 突破Cas9细胞毒性:开发宿主內源CRISPR/Cas基因编辑工具,实现无痕敲除。
- 缩短反筛周期:开发PheS*/4-CP反筛系统,加快多轮基因编辑。
- 提高编辑效率:构建最小穿梭载体,优化电转化条件,消除宿主DNA防御系统,大幅提高转化效率与基因编辑效率,为酵母基因编辑和TnpB基因编辑等服务提供参考。
应用前景:微生物基因编辑外包服务的新选择
该基因编辑系统的建立,使得我们能够快速、精准地编辑粪产碱菌基因组,为工业菌株改良提供了全新的技术手段,为开发其它细菌內源基因编辑系统提供技术参考,特别适用于非模式菌株的基因敲除和工程菌株构建。
目前,该技术已成功应用于多种细菌的基因编辑,包括乳酸菌、芽孢杆菌、大肠杆菌等常见菌种。该技术已整合到我司微生物基因编辑服务平台,提供包括基因敲除技术服务、CRISPRi基因抑制、TnpB基因编辑技术服务在内的全套解决方案。欢迎有相关需求的科研工作者联系咨询,获取免费方案。
相关服务:非模式菌株基因编辑全套解决方案
我司提供微生物基因编辑全套技术服务,包括:
- 基因敲除服务 - 非模式菌株基因敲除、无痕敲除
- 基因敲入/回补服务
- 启动子替换服务
- 多基因编辑服务
- CRISPRi基因抑制 - 基因表达调控
- TnpB基因编辑 - 新型基因编辑工具
- 工程菌株构建与代谢通路基因组整合